<
div>
Autismespectrumstoornis (ASS) is een complexe neurologische ontwikkelingsstoornis die van invloed is op de manier waarop een persoon communiceert en met anderen omgaat, en ook hoe zij de wereld om hen heen waarnemen en erop reageren. Symptomen van ASS kunnen variëren van mild tot ernstig en kunnen bestaan uit problemen met sociale interacties, problemen met verbale en non-verbale communicatie, repetitief gedrag en andere unieke uitdagingen.
Een studie onder leiding van SickKids heeft de volledige genomen van meer dan 11.000 individuen gesequenced, wat nieuwe inzichten opleverde in de genetische factoren die verband houden met autismespectrumstoornis.
De onderzoekers van het Hospital for Sick Children (SickKids) hebben nieuwe genen en genetische veranderingen met betrekking tot autismespectrumstoornis (ASS) onthuld in de meest uitgebreide sequentieanalyse van het gehele genoom van autisme tot nu toe, waardoor ons begrip van de genomische basis van ASS is verbeterd.
Het onderzoek, gepubliceerd in Cel, gebruikte sequentiebepaling van het hele genoom om het volledige genoom van meer dan 7.000 personen met autisme en nog eens 13.000 broers en zussen en familieleden te analyseren. De studie vond 134 genen die verband houden met ASS en identificeerde een reeks genetische veranderingen, met name variaties in het aantal genkopieën, die waarschijnlijk verband houden met autisme, waaronder ASS-geassocieerde zeldzame varianten die aanwezig zijn bij ongeveer 14% van de deelnemers met autisme.
Het merendeel van de gegevens is afkomstig uit de Autism Speaks MSSNG-database, ‘s werelds grootste dataset voor het volledige genoom van autisme, die autisme-onderzoekers vrije, open toegang biedt tot duizenden genoomsequenties.
« Door het volledige genoom van alle deelnemers te sequensen en met een diepe betrokkenheid van de deelnemende families in MSSNG bij het vormen van onze onderzoeksprioriteiten, maximaliseren we het potentieel voor ontdekking en maken we analyse mogelijk die alle soorten varianten omvat, van de kleinste <span class= » woordenlijstLink » aria-describedby= »tt » data-cmtooltip= »
DNA
DNA, of desoxyribonucleïnezuur, is een molecuul dat bestaat uit twee lange strengen nucleotiden die om elkaar heen kronkelen om een dubbele helix te vormen. Het is het erfelijke materiaal in mensen en bijna alle andere organismen dat genetische instructies bevat voor ontwikkeling, functioneren, groei en voortplanting. Bijna elke cel in het lichaam van een mens heeft hetzelfde DNA. Het meeste DNA bevindt zich in de celkern (waar het nucleair DNA wordt genoemd), maar een kleine hoeveelheid DNA kan ook worden gevonden in de mitochondriën (waar het mitochondriaal DNA of mtDNA wordt genoemd).
” data-gt-translate-attributen=”[{“attribute”:”data-cmtooltip”, “format”:”html”}] »>DNA-veranderingen in die welke hele chromosomen aantasten », zegt Dr. Stephen Scherer, Senior Scientist, Genetics & Genome Biology en Chief of Research bij SickKids en directeur van het McLaughlin Center aan de Universiteit van Toronto.
Dr. Brett Trost, hoofdauteur van het artikel en een onderzoeksmedewerker in het Genetics & Genome Biology-programma bij SickKids, merkt op dat het gebruik van WGS onderzoekers in staat stelde om varianttypes te ontdekken die anders niet detecteerbaar zouden zijn geweest. Deze varianttypes omvatten complexe herschikkingen van DNA, evenals herhalingsuitbreidingen achter elkaar, een bevinding die wordt ondersteund door recent SickKids-onderzoek naar het verband tussen autisme en DNA-segmenten die vele malen worden herhaald. De rol van het maternale overgeërfde mitochondriale DNA werd ook onderzocht in de studie en bleek verantwoordelijk te zijn voor twee procent van autisme.
Het artikel wijst ook op belangrijke nuances in autisme-genetica in gezinnen met slechts één persoon met autisme in vergelijking met gezinnen met meerdere personen met autisme, ook wel bekend als multiplex-families. Verrassend voor het team was dat de « polygene score » – een schatting van de waarschijnlijkheid dat een persoon autisme heeft, berekend door de effecten van duizenden veelvoorkomende varianten in het hele genoom samen te voegen – niet hoger was bij multiplexfamilies.
« Dit suggereert dat autisme in multiplex-families waarschijnlijker verband houdt met zeldzame, zeer impactvolle varianten die van een ouder zijn geërfd. Omdat zowel de genetica als de klinische kenmerken die verband houden met autisme zo complex en gevarieerd zijn, zijn grote datasets zoals die we gebruikten van cruciaal belang om onderzoekers een beter begrip te geven van de genetische architectuur van autisme”, zegt Trost.
Het onderzoeksteam zegt dat de onderzoeksgegevens kunnen helpen bij het uitbreiden van onderzoeken naar de reeks varianten die mogelijk verband houden met ASS, evenals bij pogingen om meer inzicht te krijgen in bijdragers aan de 85 procent van de autistische individuen waarvan de genetische oorzaak onopgelost blijft. In een gekoppelde studie van 325 gezinnen met ASS uit Newfoundland, gepubliceerd in <span class= »glossaryLink » aria-describedby= »tt » data-cmtooltip= »
Natuurcommunicatie
” data-gt-translate-attributen=”[{“attribute”:”data-cmtooltip”, “format”:”html”}]”>Nature Communications ontdekte het team van Dr. Scherer dat combinaties van spontane, zeldzaam overgeërfde en polygenetische genetische factoren die samenkomen in hetzelfde individu mogelijk kunnen leiden tot verschillende subtypes van autisme.
Dr. Suzanne Lewis, een geneticus en onderzoeker aan het BC Children’s Hospital Research Institute, die veel van de gezinnen die deelnamen aan de studie diagnosticeerde, zei: « Samen vormen deze nieuwste bevindingen een enorme stap voorwaarts in het beter begrijpen van de complexe genetische en biologische ASS. Deze rijke dataset biedt ook de mogelijkheid om dieper in te gaan op het onderzoeken van andere factoren die de kans van een individu op het ontwikkelen van deze complexe aandoening kunnen bepalen om toekomstige behandelingsbenaderingen te helpen individualiseren. »
Referenties: « Genomische architectuur van autisme van uitgebreide annotatie van de hele genoomsequentie » door Brett Trost, Bhooma Thiruvahindrapuram, Ada JS Chan, Worrawat Engchuan, Edward J. Higginbotham, Jennifer L. Howe, Livia O. Loureiro, Miriam S. Reuter, Delnaz Roshandel, Joe Whitney, Mehdi Zarrei, Matthew Bookman, Cherith Somerville, Rulan Shaath, Mona Abdi, Elbay Aliyev, Rohan V. Patel, Thomas Nalpathamkalam, Giovanna Pellecchia, Omar Hamdan, Gaganjot Kaur, Zhuozhi Wang, Jeffrey R. MacDonald, John Wei , Wilson WL Sung , Sylvia Lamoureux , Ny Hoang , Thanuja Selvanayagam , Nicole Deflaux , Melissa Geng , Siavash Ghaffari , John Bates , Edwin J. Young , Qiliang Ding , Carole Shum , Lia D’Abate , Clarrisa A. Bradley , Annabel Rutherford , Vernie Aguda, Beverly Apresto, Nan Chen, Sachin Desai, Xiaoyan Du, Matthew LY Fong, Sanjeev Pullenayegum, Kozue Samler, Ting Wang, Karen Ho, Tara Paton, Sergio L. Pereira, Jo-Anne Herbrick, Richard F. Wintle, Jonathan Fuerth, Naam Nopporn, Heather Ward, Patrick Mage en, Ayman Al Baz, Usanthan Kajendirarajah, Sharvari Kapadia, Jim Vlasblom, Monica Valluri, Joseph Green, Vicki Seifer, Morgan Quirbach, Olivia Rennie, Elizabeth Kelley, Nina Masjedi, Catherine Lord, Michael J. Szego, Ma’n H. Zawati , Michael Lang, Lisa J. Strug, Christian R. Marshall, Gregory Costain, Kristina Calli, Alana Iaboni, Afiqah Yusuf, Patricia Ambrozewicz, Louise Gallagher, David G. Amaral, Jessica Brian, Mayada Elsabbagh, Stelios Georgiades, Daniel S. Messinger , Sally Ozonoff , Jonathan Sebat , Calvin Sjaarda , Isabel M. Smith , Peter Szatmari , Lonnie Zwaigenbaum , Azadeh Kushki , Thomas W. Frazier , Jacob AS Vorstman , Khalid A. Fakhro , Bridget A. Fernandez , ME Suzanne Lewis , Rosanna Weksberg , Marc Fiume, Ryan KC Yuen, Evdokia Anagnostou, Neal Sondheimer, David Glazer, Dean M. Hartley en Stephen W. Scherer Cel.
DOI: 10.1016/j.cell.2022.10.009
« Genoombrede zeldzame variantscore associeert met morfologische subtypes van autismespectrumstoornis » door Ada JS Chan, Worrawat Engchuan, Miriam S. Reuter, Zhuozhi Wang, Bhooma Thiruvahindrapuram, Brett Trost, Thomas Nalpathamkalam, Carol Negrijn, Rohan V. Patel, Wilson WL Sung, Jeffrey R. MacDonald, Jennifer L. Howe, Jacob Vorstman, Neal Sondheimer, Nicole Takahashi, Judith H. Miles, Evdokia Anagnostou, Kristina Tammimiies, Mehdi Zarrei, Daniele Merico, Dimitri J. Stavropoulos, Ryan KC Yuen, Bridget A Fernandez en Stephen W. Scherer. Natuurcommunicatie.
DOI: 10.1038/s41467-022-34112-z
Financiering werd verstrekt door het McLaughlin Centre van de Universiteit van Toronto, Genome Canada/Ontario Genomics, Genome BC, Government of Ontario, Canadian Institutes of Health Research, Canada Foundation for Innovation, Autism Speaks, Autism Speaks Canada, Brain Child, Kids Brain Health Network, Qatar National Research Fund, Ontario Brain Institute, SFARI en SickKids Foundation.